Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms