Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms