Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Gtpbp6Q3U6U5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Gtpbp6Q3U6U5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Gtpbp6Q3U6U5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
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Gtpbp6Q3U6U5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Gtpbp6Q3U6U5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms