Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1Y4

Dennd4b, DENN domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd4bQ3U1Y4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dennd4bQ3U1Y4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd4bQ3U1Y4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms