Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J1

Tfpt, TCF3 fusion partner homolog, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfptQ3U1J1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TfptQ3U1J1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TfptQ3U1J1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms