Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms