Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTL0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTL0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms