Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CiartQ3TQ03 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms