Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdnep1Q3TP92 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdnep1Q3TP92 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms