Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc102aQ3TMW1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms