Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc10Q3TLI0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms