Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca4Q3TKT4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca4Q3TKT4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms