Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RubcnlQ3TD16 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RubcnlQ3TD16 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms