Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc2Q3SXD3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms