Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms