Protein–RNA interactions for Protein: Q2LA85

Treml2, Trem-like transcript 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml2Q2LA85 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml2Q2LA85 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms