Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shroom4Q1W617 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms