Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms