Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ptchd1Q14B62 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ptchd1Q14B62 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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