Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rpusd3Q14AI6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rpusd3Q14AI6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rpusd3Q14AI6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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