Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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VgfQ0VGU4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms