Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc162pQ0VG85 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms