Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms