Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms