Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf541Q0GGX2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf541Q0GGX2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms