Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700061G19RikQ08EE8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700061G19RikQ08EE8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms