Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms