Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MestQ07646 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MestQ07646 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MestQ07646 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MestQ07646 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms