Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms