Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Siah1bQ06985 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms