Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms