Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprgQ05909 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms