Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms