Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms