Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnd1Q03719 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms