Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms