Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms