Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb5Q02739 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms