Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd1Q02242 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms