Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcqQ02111 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms