Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms