Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23aQ01405 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23aQ01405 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms