Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms