Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms