Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Grin2cQ01098 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Grin2cQ01098 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms