Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms