Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou1f1Q00286 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou1f1Q00286 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou1f1Q00286 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou1f1Q00286 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou1f1Q00286 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou1f1Q00286 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou1f1Q00286 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms