Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms