Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cds1P98191 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms