Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brca2P97929 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brca2P97929 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brca2P97929 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brca2P97929 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms